Nabízíme tato témata:
Disertační práce
Diplomové práce
vedoucí práce: Ing. Miroslav Pátek, CSc.
- Regulace exprese genů účastnících se odpovědi buněk Corynebacterium glutamicum na stres vyvolaný aromatickými kontaminanty prostředí
- Purifikace RNA polymerasy z Corynebacterium glutamicum a její využití pro studium transkripce
- Funkce faktorů sigma RNA polymerasy při expresi genů stresových odpovědí u rhodokoků degradujících kontaminanty životního prostředí
- Odpověď na chemostres u bakteriálního degradéra fenolu Rhodococcus erythropolis
- Izolace a purifikace enzymů metabolismu nitrilů a studium jejich katalytických vlastností
vedoucí práce: RNDr. Maria Brennerová, CSc.
- Metagenomová analýza mikrobiálních komunit v podzemních vodách kontaminovaných chlorovanými organickými kontaminanty
Bakalářské práce
Řešené práce:
Disertační práce
vedoucí práce: Ing. Miroslav Pátek, CSc.
- Exprese genů pro nové enzymy mikrobiálního metabolismu aldoximů a nitrilů a charakterizace enzymových aktivit (Robert Rädisch)
- Funkce stresového sigma faktoru RNA polymerasy SigB u Corynebacterium glutamicum a Rhodococcus erythropolis (Andrej Rapoport)
- Překryvy stresových regulonů u korynebakterií a rhodokoků (Jan Blumenstein)
- Stresová odpověď u bakteriálního degradéra aromatických kontaminantnů životního prostředí Rhodococcus erythropolis (Lukáš Plašil)
vedoucí práce: RNDr. Maria Brennerová, CSc.
- Nové geny s funkční prioritou pro degradaci aromatických uhlovodíků ve vysoce kontaminovaném prostředí
Diplomové práce
vedoucí práce: Ing. Miroslav Pátek, CSc.
- Analýza regulačních sítí řízených sigma faktory u bakterií skupiny Mycolata rekonstruovaných s použitím modelu Corynebacterium glutamicum (Tomáš Kučera)
Bakalářské práce
vedoucí práce: Ing. Miroslav Pátek, CSc.
- Překryvy regulonů sigma faktorů RNA polymerasy u Corynebacterium glutamicum
vedoucí práce: RNDr. Václav Štěpánek, CSc.
- Funkce faktorů sigma u kmenů rodu Rhodococcus (David Nový)
- Reakce kmenů rodu Rhodococcus na působení těžkých kovů (Jan Volf)
Obhájené práce:
Disertační práce
vedoucí práce: Ing. Miroslav Pátek, CSc.
- Funkce stresových sigma faktorů RNA polymerasy SigD, SigE, SigH a SigM v transkripční regulační síti Corynebacterium glutamicum (Hana Dostálová)
- Analýza genů pro degradaci aromatických polutantů u Rhodococcus erythropolis (Juraj Szököl)
- Regulace genové exprese u kmene Rhodococcus erythropolis degradujícího xenobiotika (Monika Knoppová)
- Studium regulace biosyntézy větvených aminokyselin u Corynebacterium glutamicum a konstrukce kmene produkujícího valin (Jiří Holátko)
- Vývoj a využití genových manipulací u kmene Rhodococcus erythropolis degradujícího fenol (Martin Veselý)
vedoucí práce: RNDr. Jan Nešvera, CSc.
- Účast alternativních sigma faktorů RNA polymerasy při regulaci exprese genů Corynebacterium glutamicum (Radoslav Šilar)
- Charakterizace promotorů Corynebacterium glutamicum regulovaných zvýšenou teplotou (Martina Zemanová)
vedoucí práce: RNDr. Maria Brennerová, CSc.
- Divergentní mikrobiální konsorcia respirující organohalidy v sedimentech kontaminovaných PCB (Martina Mikešová)
Diplomové práce
vedoucí práce: Ing. Miroslav Pátek, CSc.
- Exprese genů pro konverzi nitrilů a amidů v Rhodococcus erythropolis (Martin Kracík)
- Vlastnosti expresních vektorů pro Corynebacterium glutamicum a jejich využití při studiu faktorů sigma RNA polymerasy (Pavla Dvořáková)
vedoucí práce: RNDr. Jan Nešvera, CSc.
- Funkce alternativních sigma faktorů RNA polymerasy při stresové odpovědi u Corynebacterium glutamicum (Hana Dostálová)
- Promotory Corynebacterium glutamicum regulované alternativními sigma faktory RNA polymerasy
- Analýza regulace aktivity promotoru genu per plazmidu pGA1 z Corynebacterium glutamicum (Jiří Holátko)
vedoucí práce: RNDr. Maria Brennerová, CSc.
- Monitorování rozmanitosti a degradačního potenciálu mikrobiálních komunit v oblastech České republiky znečištěných leteckým petrolejem
vedoucí práce: RNDr. Václav Štěpánek, CSc.
- Hybridní faktory sigma RNA polymerasy u Corynebacterium glutamicum (Jan Blumenstein)
Bakalářské práce
vedoucí práce: Ing. Miroslav Pátek, CSc.
- Stresové odpovědi kmenů rodu Rhodococcus
- Funkce sigma faktorů RNA polymerasy v Corynebacterium glutamicum (Pavla Dvořáková)
- Regulační síť řízená sigma faktory RNA polymerasy v Corynebacterium glutamicum (Tomáš Kučera)